Tháng 10 năm 2010, Trần Quang Minh bị Ủy ban Kiểm tra Trung ương Đảng Cộng sản Việt Nam khóa 10 kỉ luật cảnh cáo về Đảng vì " đã thiếu trách nhiệm tham mưu giúp tổng cục trưởng trong lĩnh vực công tác được phân công; để đơn vị thực hiện không đúng các quy định của Nhà nước và Bộ Công an trong việc tổ chức mua sắm hàng hóa trong thời gian dài, gây thất thoát ngân sách Nhà nước, ảnh hưởng đến uy tín tập thể, cá nhân."[2][3][4]